Cup Slovakia tổng cộng có 6 vòng đấu, đội bóng thuộc giải VĐQG Slovakia bắt đầu thi đấu từ vòng top 32. Vòng top 32 đến vòng top 8, các đội phân hạ qua một trận đấu, nếu không thể phân hạ ở phút thứ 90 thì tiến hành điểm phạt bóng. Vòng bán kết thi đấu hai lượt sân nhà và khách, nếu tổng điểm số của hai lượt băng nhau thì tích theo thành tích sân khách. Trận chung kết thi đấu tại sân trương trung lập, nếu không thể phân hạ ở phút thứ 90 thì đá hiệp phụ, nếu vẫn hòa nhau thì phân hạ qua điểm phạt bóng.